goSorensen

DOI:10.18129 / B9.bioc.goSorensen

这是发展goSorensen版本;稳定的发布版本,请参阅goSorensen。

统计推断基于Sorensen-Dice不同和基因本体论(去)

Bioconductor版本:发展(3.18)

这个方案实现了推理方法比较基因列表(在这第一个版本,证明等价)的生物中表达意思同去。相比基因列表具有丰富的交叉表频率表项。不同基因列表之间使用Sorensen-Dice评估指数。最根本的指导原则是两个基因列表作为类似,如果他们分享共同丰富的很大一部分物品。

作者:巴勃罗·弗洛雷斯(aut (cre),乔迪Ocana aut,施莱(0000-0002-4736-699),亚历山大Sanchez-Pla(施),Miquel Salicru(施)

维护人员:巴勃罗·弗洛雷斯< p_flores在espoch.edu.ec >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“goSorensen”)

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文档

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HTML	R脚本	介绍使用goSorensen等价测试之间的特性列表。
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文本		新闻

细节

biocViews	注释,聚类,去,GeneExpression,GeneSetEnrichment,GraphAndNetwork,KEGG,微阵列,MultipleComparison,通路,Reactome,软件
版本	1.3.0
Bioconductor自	BioC 3.16 (r - 4.2)(0.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.2.0)
进口	GO.db,org.Hs.eg.db,goProfiles统计数据,clusterProfiler、并行
链接
建议	BiocStyle、knitr rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	goSorensen_1.3.0.tar.gz
Windows二进制	goSorensen_1.3.0.zip
macOS二进制(x86_64)	goSorensen_1.3.0.tgz
macOS二进制(arm64)	goSorensen_1.3.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/goSorensen
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ goSorensen
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/goSorensen/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/goSorensen/
包下载报告	下载数据