这是发展Gmoviz的版本;对于稳定版本,请参阅Gmoviz。
生物导体版本:开发(3.16)
在各种生物学研究中,转基因的生物(GMO)和细胞系是广泛使用的模型。作为表征这些模型的一部分,DNA测序技术和生物信息学分析被系统地用于研究其基因组。因此,生成大量数据,并应用各种算法来分析这些数据,这引入了以信息和简洁的方式代表所有发现的挑战。“ Gmoviz”为用户提供了一种简单的方法,可以在更大的,与生物学的量表上可视化和促进复杂的基因组编辑事件的解释。
作者:Kathleen Zeglinski [CRE,AUT],Arthur HSU [AUT],Monterer Alhamdoosh [aut],康斯坦丁斯·库塔基斯[aut]
维护人员:kathleen Zeglinski
引用(从r内,输入引用(“ Gmoviz”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ gmoviz”)的用法
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Gmoviz”)
html | R脚本 | Gmoviz的高级用法 |
html | R脚本 | Gmoviz简介 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 覆盖范围,,,,遗传因素,,,,基因组变量,,,,测序,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.9.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.11(R-4.0)(2。5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | 循环,,,,基因组机,图形,R(> = 4.0) |
进口 | 网格,Gridbase,,,,rsamtools,,,,复杂的图像,,,,生物基因,,,,生物弦,,,,GenomeInfodB, 方法,基因组签名,,,,GenomicFeatures,,,,iranges,,,,rtracklayer,,,,pracma,,,,色彩空间,,,,S4VECTORS |
链接 | |
建议 | 测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,pasillabamsubset,,,,生物使用,,,,生物管理器 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | gmoviz_1.9.0.tar.gz |
Windows二进制 | gmoviz_1.9.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | gmoviz_1.9.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gmoviz |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/gmoviz |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/gmoviz/ |
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