Gmoviz

doi:10.18129/b9.bioc.gmoviz

这是发展Gmoviz的版本;对于稳定版本,请参阅Gmoviz

GMO和编辑细胞系中复杂基因组变异的无缝可视化

生物导体版本:开发(3.16)

在各种生物学研究中,转基因的生物(GMO)和细胞系是广泛使用的模型。作为表征这些模型的一部分,DNA测序技术和生物信息学分析被系统地用于研究其基因组。因此,生成大量数据,并应用各种算法来分析这些数据,这引入了以信息和简洁的方式代表所有发现的挑战。“ Gmoviz”为用户提供了一种简单的方法,可以在更大的,与生物学的量表上可视化和促进复杂的基因组编辑事件的解释。

作者:Kathleen Zeglinski [CRE,AUT],Arthur HSU [AUT],Monterer Alhamdoosh [aut],康斯坦丁斯·库塔基斯[aut]

维护人员:kathleen Zeglinski

引用(从r内,输入引用(“ Gmoviz”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ gmoviz”)的用法

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Gmoviz”)

html R脚本 Gmoviz的高级用法
html R脚本 Gmoviz简介
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 覆盖范围,,,,遗传因素,,,,基因组变量,,,,测序,,,,软件,,,,可视化
版本 1.9.0
在生物导体中 Bioc 3.11(R-4.0)(2。5年)
执照 GPL-3
要看 循环,,,,基因组机,图形,R(> = 4.0)
进口 网格,Gridbase,,,,rsamtools,,,,复杂的图像,,,,生物基因,,,,生物弦,,,,GenomeInfodB, 方法,基因组签名,,,,GenomicFeatures,,,,iranges,,,,rtracklayer,,,,pracma,,,,色彩空间,,,,S4VECTORS
链接
建议 测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,pasillabamsubset,,,,生物使用,,,,生物管理器
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 gmoviz_1.9.0.tar.gz
Windows二进制 gmoviz_1.9.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) gmoviz_1.9.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gmoviz
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/gmoviz
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/gmoviz/
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