ggmanh

DOI:10.18129 / B9.bioc.ggmanh

这是发展ggmanh版本;稳定的发布版本,请参阅ggmanh。

可视化工具对GWAS的结果

Bioconductor版本:发展(3.18)

曼哈顿的情节和QQ情节一般用于可视化全基因组关联研究的最终结果。“ggmanh”包旨在将这些情节简单的生成,同时保持可定制性。主要功能包括manhattan_plot qqunif, thinPoints。

作者:约翰•李(aut (cre) Xiuwen郑(施,dtc)

维护人员:李约翰<约翰。李在abbvie.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“ggmanh”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ggmanh”)

HTML	R脚本	指南ggmanh包
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	遗传学,GenomeWideAssociation,软件,可视化
版本	1.5.0
Bioconductor自	BioC 3.15 (r - 4.2)(1年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	方法,ggplot2
进口	gdsfmt,grDevices ggrepel RColorBrewer rlang,尺度,SeqArray(> = 1.32.0),统计数据
链接
建议	BiocStyle,knitr rmarkdown testthat(> = 3.0.0),减价,GenomicRanges
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	SAIGEgds
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ggmanh_1.5.0.tar.gz
Windows二进制	ggmanh_1.5.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	ggmanh_1.5.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ggmanh
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ggmanh
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/ggmanh/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ggmanh/
包下载报告	下载数据