- 家
- Bioconductor 3.17
- 软件包
- gespeR(开发版)
gespeR
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
DOI:10.18129 / B9.bioc.gespeR
这是发展gespeR版本;稳定的发布版本,请参阅gespeR。
Gene-Specific表型估计量
Bioconductor版本:发展(3.17)
估计gene-specific表型从脱靶困惑RNAi屏幕。每个核的表现型建模是基于目标和非目标基因,使用一个正规化的线性回归模型。
作者:费边Schmich
维修工:费边Schmich <费边。在bsse.ethz.ch schmich >
从内部引用(R,回车引用(“gespeR”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“gespeR”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“gespeR”)
| R脚本 | R包deconvoluting脱靶困惑RNAi屏幕 | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | CellBasedAssays,GeneTarget,ImmunoOncology,预处理,回归,软件,可视化 |
| 版本 | 1.31.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.1 (r - 3.2)(8年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | 方法、图形ggplot2R (> = 2.10) |
| 进口 | 矩阵,glmnet,cellHTS2,Biobase,biomaRt,doParallel平行,foreach,reshape2,dplyr |
| 链接 | |
| 建议 | knitr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://www.cbg.ethz.ch/software/gespeR |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | gespeR_1.31.0.tar.gz |
| Windows二进制 | gespeR_1.31.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | gespeR_1.31.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | gespeR_1.31.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gespeR |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ gespeR |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/gespeR/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/gespeR/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
