这是发展GenomeIntervals的版本;对于稳定版本,请参阅基因组合。
生物导体版本:开发(3.16)
该软件包定义了用于表示基因组间隔的类,并提供了与之合作的功能和方法。注意:软件包为“ girafe”软件包提供了基本基础架构,并增强了。
作者:Julien Gagneur
维护者:Julien Gagneur
引用(从r内,输入引用(“基因组合”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version ='devel')biocmanager :: install(“ GenomeIntervals”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“基因组合”)
R脚本 | GenomeIntervals软件包的概述。 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | DataImport,,,,遗传学,,,,基础设施,,,,软件 |
版本 | 1.53.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.4(R-2.9)(13。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | R(> = 2.15.0),方法,间隔(> = 0.14.0),生物基因(> = 0.15.2) |
进口 | GenomeInfodB(> = 1.5.8),基因组机(> = 1.21.16),iranges(> = 2.3.14),S4VECTORS(> = 0.7.10) |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | 别致,,,,girafe |
进口我 | 时尚,,,,EasyRnaseq |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | GenomeIntervals_1.53.0.tar.gz |
Windows二进制 | genomeIntervals_1.53.0.zip(仅64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | GenomeIntervals_1.53.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genomeintervals |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/GenomeIntervals |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/genomeintervals/ |
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