基因组合

doi:10.18129/b9.bioc.genomeintervals

这是发展GenomeIntervals的版本;对于稳定版本,请参阅基因组合

基因组间隔的操作

生物导体版本:开发(3.16)

该软件包定义了用于表示基因组间隔的类,并提供了与之合作的功能和方法。注意:软件包为“ girafe”软件包提供了基本基础架构,并增强了。

作者:Julien Gagneur ,乔恩·托德林(Joern Toedling),理查德·伯贡(Richard Bourgon)

维护者:Julien Gagneur

引用(从r内,输入引用(“基因组合”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version ='devel')biocmanager :: install(“ GenomeIntervals”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“基因组合”)

PDF R脚本 GenomeIntervals软件包的概述。
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 DataImport,,,,遗传学,,,,基础设施,,,,软件
版本 1.53.0
在生物导体中 Bioc 2.4(R-2.9)(13。5年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 2.15.0),方法,间隔(> = 0.14.0),生物基因(> = 0.15.2)
进口 GenomeInfodB(> = 1.5.8),基因组机(> = 1.21.16),iranges(> = 2.3.14),S4VECTORS(> = 0.7.10)
链接
建议
系统要求
增强
URL
取决于我 别致,,,,girafe
进口我 时尚,,,,EasyRnaseq
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 GenomeIntervals_1.53.0.tar.gz
Windows二进制 genomeIntervals_1.53.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) GenomeIntervals_1.53.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genomeintervals
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/GenomeIntervals
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/genomeintervals/
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