geneplotter

DOI:10.18129 / B9.bioc.geneplotter

这是发展geneplotter版本;稳定的发布版本,请参阅geneplotter。

图形为Bioconductor相关功能

Bioconductor版本:发展(3.17)

函数绘制基因组数据

作者:r .绅士,Biocore

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“geneplotter”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“geneplotter”)

PDF	R脚本	如何组装chromLocation对象
PDF	R脚本	微阵列数据的可视化
PDF		参考手册
文本		自述
文本		新闻

细节

biocViews	软件,可视化
版本	1.77.0
Bioconductor自	BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 17.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(> = 2.10),方法,Biobase,BiocGenerics,晶格,注释
进口	AnnotationDbi、图形grDevices、网格RColorBrewer统计,跑龙套
链接
建议	Rgraphviz,fibroEset,hgu95av2.db,hu6800.db,hgu133a.db
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	HD2013SGI,Hiiragi2013,maEndToEnd
进口我	biocGraph,DEXSeq,ENmix,MethylSeekR,RNAinteract
建议我	AgiMicroRna,biocGraph,类别,EnrichmentBrowser,GOstats,Single.mTEC.Transcriptomes
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	geneplotter_1.77.0.tar.gz
Windows二进制	geneplotter_1.77.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	geneplotter_1.77.0.tgz
macOS二进制(arm64)	geneplotter_1.77.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/geneplotter
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ geneplotter
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/geneplotter/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/geneplotter/
包下载报告	下载数据