GeneFilter

doi:10.18129/b9.bioc.genefilter

这是发展GeneFilter的版本;对于稳定版本,请参阅GeneFilter

GeneFilter:高通量实验过滤基因的方法

生物导体版本:开发(3.16)

过滤基因的一些基本功能。

作者:罗伯特绅士,文森特·J·凯里,沃尔夫冈·胡伯,弗洛里安·哈恩

维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>

引用(从r内,输入引用(“基因词”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ genefilter”)的用法

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ GeneFilter”)

PDF R脚本 01-使用GeneFilter函数从微阵列数据集过滤基因
PDF R脚本 02-如何找到表达曲线与指定基因相似的基因
PDF R脚本 03-其他图:独立过滤增加了检测差异表达基因的功率,Bourgon等人,PNAS(2010)
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 微阵列,,,,软件
版本 1.79.0
在生物导体中 Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 17年)
执照 艺术2.0
要看
进口 生物基因,,,,AnnotationDbi,,,,注释,,,,生物酶,图形,方法,统计,生存,grdevices
链接
建议 班级,,,,HGU95AV2.DB,,,,tkwidgets,,,,全部,,,,,,,,rcolorbrewer,,,,生物使用,,,,尼特
系统要求
增强
URL
取决于我 CellHTS2,,,,cntools,,,,Genemeta,,,,Hiiragi2013,,,,Maendtoend,,,,rnaseqgene,,,,Sispa,,,,SVA
进口我 A4base,,,,Annmap,,,,ArrayQualityMetrics,,,,类别,,,,CBAF,,,,countsimqc,,,,covrna,,,,deseq2,,,,dexseq,,,,enmix,,,,flowsorted.blood.epic,,,,GISPA,,,,GSRI,,,,ihwpaper,,,,metaseqr2,,,,甲基接受,,,,甲基菌,,,,Minfi,,,,mlinterfaces,,,,莫格萨,,,,nbamseq,,,,nxtirfcore,,,,PCAEXPLORER,,,,佩卡,,,,,,,,protgear,,,,pwrewas,,,,林戈,,,,rnainteractmapk,,,,空间Heatmap,,,,蒂格拉里,,,,XDE,,,,Zinbwave
建议我 注释,,,,Bionet,,,,BloodCancermultiomics2017,,,,类别Compare,,,,分类,,,,,,,,codelink,,,,可乐,,,,compcoder,,,,策划的布拉德达塔,,,,策展,,,,策展人,,,,延迟,,,,富集图,,,,事实设计,,,,FFPE,,,,ffpeexampledata,,,,Gagedata,,,,Genomicfiles,,,,gostats,,,,GSAR,,,,gsealm,,,,GSVA,,,,逻辑,,,,Lumi,,,,maqcsubset,,,,mmuphin,,,,NPGSEA,,,,奥利戈,,,,门索,,,,PVAC,,,,qpgraph,,,,rforpoteomics,,,,风湿性调节wollbold,,,,rtracklayer,,,,siggenes,,,,简化,,,,single.mtec.transcriptomes,,,,tcgabiolinks,,,,topgo
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 genefilter_1.79.0.tar.gz
Windows二进制 genefilter_1.79.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) genefilter_1.79.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genefilter
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/GenFilter
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/genefilter/
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