geneRxCluster

DOI:10.18129 / B9.bioc.geneRxCluster

这是发展geneRxCluster版本;稳定的发布版本,请参阅geneRxCluster。

gRx微分集群

Bioconductor版本:发展(3.17)

检测微分基因组基因疗法等网站集成的集群。包提供了一些功能探索基因组插入网站来自两个不同的来源。可能,这两个来源是两个不同的基因治疗载体。向量是首选目标敏感区域的频率更低,激励寻找局部集群的插入和比较集群由集成不同的向量。扫描数据允许的发现空间聚类和计算错误发现率的差异(罗斯福)提供统计方法比较逆转录病毒载体。扫描统计量来比较两个向量使用多个窗口宽度检测聚类差异和计算罗斯福在这里实现。

作者:查尔斯·贝瑞

维修工:查尔斯·贝瑞< ccberry ucsd.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“geneRxCluster”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“geneRxCluster”)

PDF	R脚本	使用geneRxCluster
PDF		参考手册

细节

biocViews	聚类,遗传学,测序,软件
版本	1.35.0
Bioconductor自	BioC 2.14 (r - 3.1)(9年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	GenomicRanges,IRanges
进口
链接
建议	RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	geneRxCluster_1.35.0.tar.gz
Windows二进制	geneRxCluster_1.35.0.zip
macOS二进制(x86_64)	geneRxCluster_1.35.0.tgz
macOS二进制(arm64)	geneRxCluster_1.35.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/geneRxCluster
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ geneRxCluster
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/geneRxCluster/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/geneRxCluster/
包下载报告	下载数据