genbankr

DOI:10.18129 / B9.bioc.genbankr

这是发展genbankr版本;稳定的发布版本,请参阅genbankr。

解析基因库文件到语义上有用的对象

Bioconductor版本:发展(3.14)

读取基因库文件。

作者:加布里埃尔·贝克尔(aut (cre),迈克尔·劳伦斯(aut)

维修工:加布里埃尔·贝克尔<贝克。加布里埃尔:gene.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“genbankr”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“genbankr”)

HTML	R脚本	介绍genbankr
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,基础设施,软件
版本	1.21.0
Bioconductor自	BioC 3.3 (r - 3.3)(5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	方法
进口	BiocGenerics,IRanges(> = 2.13.15),GenomicRanges(> = 1.31.10),GenomicFeatures(> = 1.31.5),Biostrings,VariantAnnotation,rtracklayer,S4Vectors(> = 0.17.28),GenomeInfoDb,Biobase
链接
建议	RUnit,rentrez,knitr,rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	PACVr
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	genbankr_1.21.0.tar.gz
Windows二进制	genbankr_1.21.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	genbankr_1.21.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genbankr
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ genbankr
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/genbankr/
包下载报告	下载数据