fobitools

DOI:10.18129 / B9.bioc.fobitools

这是发展fobitool的版本;稳定版请参见fobitools．

操作FOBI本体的工具

Bioconductor版本:开发(3.17)

一套与食品生物标记本体(FOBI)交互的工具。一组用于生物意义分析、图表和注释营养数据的文本挖掘策略的基本操作工具。

作者:Pol Castellano-Escuder [aut, cre]，克里斯蒂娜Andrés-Lacueva [aut]， Alex Sánchez-Pla [aut]

维护者:Pol Castellano-Escuder

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("fobitools")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“fobitools”)

超文本标记语言	R脚本	膳食文本注释
超文本标记语言	R脚本	简单的食物ORA
超文本标记语言	R脚本	用例ST000291
超文本标记语言	R脚本	用例ST000629
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释，BiomedicalInformatics，Cheminformatics，GeneSetEnrichment，GraphAndNetwork，MassSpectrometry，代谢组学，通路，软件，可视化
版本	1.7.0
在Bioconductor	BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.1)
进口	clisymbols，蜡笔，dplyr，fgsea，ggplot2，ggraph，magrittr，ontologyIndex，purrr，RecordLinkage，stringr，textclean，发出滴答声，tidygraph，tidyr，发呜呜声
链接
建议	BiocStyle，covr，ggrepel，kableExtra，knitr，metabolomicsWorkbenchR，POMA，rmarkdown，房车，SummarizedExperiment，testthat2.3.2 (> =)tidyverse
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/pcastellanoescuder/fobitools/
BugReports	https://github.com/pcastellanoescuder/fobitools/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	fobitools_1.7.0.tar.gz
Windows二进制	fobitools_1.7.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	fobitools_1.7.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	fobitools_1.7.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fobitools
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ fobittools
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/fobitools/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/fobitools/
软件包下载报告	下载数据