FMCSR

doi:10.18129/b9.bioc.fmcsr

这是发展FMCSR的版本;对于稳定版本,请参阅FMCSR

不匹配的最大公共子结构搜索不匹配

生物导体版本:开发(3.16)

FMCSR软件包引入了一种有效的最大公共结构(MCS)算法,并结合了一种新型的匹配策略,该策略允许在两个小分子中共享的子结构中进行原子和/或键不匹配。所得的柔性MCS(FMCSS)通常比严格的MCS大,从而鉴定出其源结构中更常见的特征,并且在寻找具有较弱结构相似性的化合物时具有更高的灵敏度。FMCSR软件包提供了多个实用程序,用于使用FMCS算法进行成对化合物比较,结构相似性搜索和聚类。

作者:Yan Wang,Tyler Backman,Kevin Horan,Thomas Girke

维护者:thomas girke

引用(从r内,输入引用(“ FMCSR”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ fmcsr”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ FMCSR”)

html R脚本 FMCSR
PDF 参考手册
文本 读书我
文本 消息

细节

生物浏览 生物医学信息学,,,,蜂窝基,,,,化学信息学,,,,聚类,,,,DataImport,,,,基础设施,,,,代谢组学,,,,MicrotReplateassay,,,,药物遗传学,,,,药物基因组学,,,,蛋白质组学,,,,软件,,,,可视化
版本 1.39.0
在生物导体中 Bioc 2.11(R-2.15)(9。5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 2.10.0),化学机器, 方法
进口 运行, 方法,化学机器,,,,生物基因, 平行
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,编织,,,,Knitrbootstrap,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL https://github.com/girke-lab/fmcsr
取决于我
进口我
建议我 化学机器
链接到我
构建报告

包装档案

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源包 fmcsr_1.39.0.tar.gz
Windows二进制 fmcsr_1.39.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) fmcsr_1.39.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fmcsr
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/fmcsr
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/fmcsr/
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