flowSpecs

DOI:10.18129 / B9.bioc.flowSpecs

这是发展flowSpecs版本;稳定的发布版本,请参阅flowSpecs。

高维血细胞计数数据的工具进行处理

Bioconductor版本:发展(3.17)

这个包是为了填补传统的角色血细胞计数预处理软件,谱分解、转换、可视化和清理,并援助下游分析,与服饰等,通过启用flowFrames转型和flowSets dataframes。函数flowCore-compliant自动1 d-gating /过滤管道。包的名称选择将处理光谱血细胞计数,这将有希望给用户一个很好的副眼镜通过查看他们的数据。

作者:Jakob Theorell (aut (cre)

维护人员:Jakob Theorell <雅克布。在ki.se theorell >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“flowSpecs”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“flowSpecs”)

HTML	R脚本	原始光谱血细胞计数文件的示例工作流进行处理
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	CellBasedAssays,DataImport,DataRepresentation,FlowCytometry,ImmunoOncology,归一化,SingleCell,软件,可视化
版本	1.13.0
Bioconductor自	BioC 3.10 (r - 3.6)(3年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 4.0)
进口	ggplot2(> = 3.1.0),BiocGenerics(> = 0.30.0),BiocParallel(> = 1.18.1),Biobase(> = 2.48.0),reshape2(> = 3),flowCore(> = 1.50.0),动物园(> = 1.8.6),数据(> = 3.6.0)、方法(> = 3.6.0)
链接
建议	testthat,knitr,rmarkdown,BiocStyle,服饰
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/jtheorell/flowSpecs/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	flowSpecs_1.13.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowSpecs
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ flowSpecs
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/flowSpecs/
包下载报告	下载数据