flowGraph

DOI:10.18129 / B9.bioc.flowGraph

这是发展flowGraph版本;稳定版请参见flowGraph

根据标记物频率,在流式细胞术数据中鉴定不同的细胞群

Bioconductor版本:开发(3.17)

考虑到细胞群之间的依赖性,在流式细胞术数据中确定最大的差异细胞群;flowGraph计算并绘制给定细胞群细胞计数的SpecEnr丰度分数。

作者:Alice Yue [aut, cre]

维护者:Alice Yue

引文(从R内,输入引用(“flowGraph”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("flowGraph")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“flowGraph”)

超文本标记语言 R脚本 flowGraph
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews CellBasedAssaysFlowCytometryImmunoOncology软件StatisticalMethod可视化
版本 1.7.0
在Bioconductor BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 4.1)
进口 effsizefurrr未来purrrggiraphggrepelggplot2igraph矩阵matrixStats,统计,utils,visNetworkhtmlwidgets, grDevices,方法,stringrstringiRdpackdata.table(> = 1.9.5),gridExtra
链接
建议 BiocStyledplyrknitrrmarkdowntestthat(> = 2.1.0的)
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/aya49/flowGraph
BugReports https://github.com/aya49/flowGraph/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 flowGraph_1.7.0.tar.gz
Windows二进制 flowGraph_1.7.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64) flowGraph_1.7.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) flowGraph_1.7.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowGraph
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/flowGraph
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/flowGraph/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/flowGraph/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网