这是发展flowGraph版本;稳定版请参见flowGraph.
Bioconductor版本:开发(3.17)
考虑到细胞群之间的依赖性,在流式细胞术数据中确定最大的差异细胞群;flowGraph计算并绘制给定细胞群细胞计数的SpecEnr丰度分数。
作者:Alice Yue [aut, cre]
维护者:Alice Yue
引文(从R内,输入引用(“flowGraph”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.3”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("flowGraph")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“flowGraph”)
超文本标记语言 | R脚本 | flowGraph |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | CellBasedAssays,FlowCytometry,ImmunoOncology,软件,StatisticalMethod,可视化 |
版本 | 1.7.0 |
在Bioconductor | BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 4.1) |
进口 | effsize,furrr,未来,purrr,ggiraph,ggrepel,ggplot2,igraph,矩阵,matrixStats,统计,utils,visNetwork,htmlwidgets, grDevices,方法,stringr,stringi,Rdpack,data.table(> = 1.9.5),gridExtra |
链接 | |
建议 | BiocStyle,dplyr,knitr,rmarkdown,testthat(> = 2.1.0的) |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/aya49/flowGraph |
BugReports | https://github.com/aya49/flowGraph/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | flowGraph_1.7.0.tar.gz |
Windows二进制 | flowGraph_1.7.0.zip(64位) |
macOS二进制文件(x86_64) | flowGraph_1.7.0.tgz |
macOS二进制文件(arm64) | flowGraph_1.7.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowGraph |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/flowGraph |
生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/flowGraph/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/flowGraph/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |