flowCore

DOI:10.18129 / B9.bioc.flowCore

这是发展flowCore的版本;稳定版请参见flowCore．

flowCore:流式细胞仪数据的基本结构

Bioconductor版本:开发(3.16)

提供S4数据结构和处理流式细胞术数据的基本功能。

作者:B Ellis [aut]， Perry Haaland [aut]， Florian Hahne [aut]， Nolwenn Le Meur [aut]， Nishant Gopalakrishnan [aut]， Josef Spidlen [aut]， Mike Jiang [aut, cre]， Greg Finak [aut]， Samuel Granjeaud [ctb]

维护者:Mike Jiang < Mike at ozette.ai>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("flowCore")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“flowCore”)

PDF	R脚本	流式细胞仪数据的基本功能
超文本标记语言		fcs3.html
超文本标记语言		hyperlog.notice.html
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CellBasedAssays，FlowCytometry，ImmunoOncology，基础设施，软件
版本	2.9.0
在Bioconductor	BioC 2.0 (R-2.5)(15年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.5.0)
进口	Biobase，BiocGenerics(>= 0.29.2)， grDevices，图形，方法，统计，utils, stats4，Rcpp，matrixStats，cytolib(> = 2.3.4),S4Vectors
链接	Rcpp，RcppArmadillo，黑洞(> = 1.65.0.1),cytolib，RProtoBufLib
建议	Rgraphviz，flowViz，flowStats(> = 3.43.4),testthat，flowWorkspace，flowWorkspaceData，openCyto，knitr，ggcyto，gridExtra
SystemRequirements	GNU制作，c++ 11
增强了
URL
全靠我	flowBeads，flowBin，flowClean，flowCut，flowFP，flowMatch，flowTime，flowTrans，flowViz，flowVS，ggcyto，HDCytoData，healthyFlowData，highthroughputassays，immunoClust，infinityFlow，ncdfFlow
进口我	催化剂，cmapR，承认，cyanoFilter，cydar，CytoDx，cytoMEM，CytoML，CytoTree，ddPCRclust，diffcyt，flowAI，flowBeads，flowCHIC，flowClust，flowDensity，flowMeans，flowMerge，flowPloidy，FlowSOM，flowSpecs，flowStats，flowTrans，flowUtils，flowViz，flowWorkspace，GateFinder，ImmuneSpaceR，MetaCyto，ncdfFlow，oneSENSE，openCyto，PeacoQC，scDataviz，Sconify
建议我	指南针，flowPloidyData
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	flowCore_2.9.0.tar.gz
Windows二进制	flowCore_2.9.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	flowCore_2.9.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowCore
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/flowCore
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/flowCore/
软件包下载报告	下载数据