flowClust

DOI:10.18129 / B9.bioc.flowClust

这是发展flowClust的版本;稳定版请参见flowClust

流式细胞术的聚类

Bioconductor版本:开发(3.17)

使用带有Box-Cox变换的t混合模型的鲁棒基于模型的聚类。注意:用户需要安装GSL。Windows用户:“参考源发行版的inst目录中可用的README文件以获得必要的配置说明”。

作者:Raphael Gottardo, Kenneth Lo。Lo在stat。ubc。ca>, Greg Finak < Greg at ozette.ai>

维护者:Greg Finak < Greg at ozette。ai>, Mike Jiang < Mike at ozette.ai>

引文(从R内,输入引用(“flowClust”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("flowClust")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“flowClust”)

超文本标记语言 R脚本 基于模型的流式细胞仪数据聚类\\ flowClust包
PDF 参考手册
文本 自述
文本 新闻

细节

biocViews 聚类FlowCytometryImmunoOncology软件可视化
版本 3.37.0
在Bioconductor BioC 2.2 (R-2.7)(14.5年)
许可证 麻省理工学院
取决于 R (>= 2.5.0)
进口 BiocGenerics、方法、BiobaseflowCore、并行
链接
建议 testthatflowWorkspaceflowWorkspaceDataknitrrmarkdownopenCytoflowStats(> = 4.7.1)
SystemRequirements GNU使
增强了
URL
全靠我 flowMergeflowTrans
进口我 承认cyanoFilterflowTransopenCyto
建议我 BiocGenericsflowTime
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 flowClust_3.37.0.tar.gz
Windows二进制 flowClust_3.37.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) flowClust_3.37.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) flowClust_3.37.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowClust
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/flowClust
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/flowClust/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/flowClust/
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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网