农场

DOI:10.18129 / B9.bioc.farms

这是发展版本的农场;稳定的发布版本请参见农场。

用于稳健微阵列总结的因子分析

生物导体版本:开发(3.14)

该包提供了一种名为“稳健微阵列摘要因子分析(FARMS)”的摘要算法，以及一种名为“I/NI-calls”的新型无监督特征选择标准。

作者:Djork-Arne Clevert

维护人:Djork-Arne Clevert

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("farms")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“农场”)

PDF	R脚本	使用农场
PDF		参考手册

细节

biocViews	GeneExpression,微阵列,预处理,质量控制,软件
版本	1.45.0
Bioconductor自	BioC 2.7 (R-2.12)(10.5年)
许可证	LGPL (> = 2.1)
取决于	R (> = 2.8),affy(> = 1.20.0),质量、方法
进口	affy,质量,Biobase(>= 1.13.41)，方法，图形
链接
建议	affydata,Biobase,跑龙套
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.bioinf.jku.at/software/farms/farms.html
取决于我
进口我
建议我	DEqMS
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	farms_1.45.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)	farms_1.45.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/farms
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/农场
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/farms/
包下载报告	下载数据