fCI

DOI:10.18129 / B9.bioc.fCI

这是发展fCI版本;稳定版请参见fCI．

转录组学和蛋白质组学差异表达分析的f-发散截断指数

Bioconductor版本:开发(3.16)

(f-divergence Cutoff Index)，是在转录组和蛋白质组数据中寻找DEGs，通过计算对照-对照的折叠变化分布与剩余(无差异)病例-对照基因表达比数据的差异来识别DEGs。与现有方法相比，fCI提供了几个优点。

作者:唐少军

维护人员:唐绍军

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("fCI")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes (fCI)

超文本标记语言	R脚本	fCI
PDF		参考手册

细节

biocViews	蛋白质组学，软件
版本	1.27.0
在Bioconductor	BioC 3.2 (R-3.2)(7年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 3.1)，模糊神经网络，心理，gtools，动物园，rgl、网格维恩图
进口
链接
建议	knitr，rmarkdown，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	fCI_1.27.0.tar.gz
Windows二进制	fCI_1.27.0.zip(64位)
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fCI
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/fCI
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/fCI/
软件包下载报告	下载数据