fCCAC

DOI:10.18129 / B9.bioc.fCCAC

这是发展fCCAC版本;稳定版请参见fCCAC．

功能典型相关分析用于评估核酸测序数据集之间的协方差

Bioconductor版本:开发(3.17)

对DNA或RNA测序数据集的变异性进行计算评估是基因组学中至关重要的一步，因为它既可以评估重复的可重复性，也可以比较不同的数据集以确定潜在的相关性。fCCAC应用功能典型相关分析来评估:(i)生物或技术重复的可重复性，分析它们在高阶分量中的共享协方差;以及(ii)不同数据集之间的关联。fCCAC代表了一种更复杂的方法，它补充了基因组覆盖的Pearson相关性。

作者:Pedro Madrigal [aut, cre]

维护者:Pedro Madrigal

安装

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如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("fCCAC")

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文档

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browseVignettes(“fCCAC”)

PDF	R脚本	fCCAC装饰图案
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文本		新闻

细节

biocViews	ATACSeq，ChIPSeq，报道，表观遗传学，FunctionalGenomics，MNaseSeq，RNASeq，测序，软件，转录
版本	1.25.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(6.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.2.0)，S4Vectors，IRanges，GenomicRanges、网格
进口	食品及药物管理局，RColorBrewer，genomation，ggplot2，ComplexHeatmap， grDevices, stats, utils
链接
建议	RUnit，BiocGenerics，BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
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构建报告

包档案

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源包	fCCAC_1.25.0.tar.gz
Windows二进制	fCCAC_1.25.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	fCCAC_1.25.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	fCCAC_1.25.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fCCAC
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/fCCAC
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/fCCAC/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/fCCAC/
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