esetVis

DOI:10.18129 / B9.bioc.esetVis

这是发展esetVis版本;稳定的发布版本,请参阅esetVis。

的可视化expressionSet Bioconductor对象

Bioconductor版本:发展(3.17)

效用函数的可视化expressionSet(或SummarizedExperiment) Bioconductor对象,包括光谱图、tsne和线性判别分析。静态图通过ggplot2包或互动通过ggvis rbokeh包是可用的。

作者:罗兰Cougnaud <罗兰。在openanalytics.eu cougnaud >

Laure Cougnaud维护者:<罗兰。在openanalytics.eu cougnaud >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“esetVis”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“esetVis”)

HTML	R脚本	esetVis包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataRepresentation,DimensionReduction,通路,PrincipalComponent,软件,可视化
版本	1.25.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(6.5年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	mpm,hexbin,Rtsne,中长期规划、网格Biobase,质量统计,跑龙套,grDevices方法
链接
建议	ggplot2,ggvis,rbokeh,ggrepel,knitr,rmarkdown,所有,hgu95av2.db,AnnotationDbi,老鸨,SummarizedExperiment
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	esetVis_1.25.0.tar.gz
Windows二进制	esetVis_1.25.0.zip
macOS二进制(x86_64)	esetVis_1.25.0.tgz
macOS二进制(arm64)	esetVis_1.25.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/esetVis
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ esetVis
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/esetVis/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/esetVis/
包下载报告	下载数据