逃脱

doi：10.18129/b9.bioc.escape

这是发展Escape的版本；对于稳定版本，请参阅逃脱。

简单的单细胞分析平台用于丰富

生物导体版本：开发（3.16）

在单细胞RNA测序的背景下，一个促进基因集富集分析（GSEA）的桥接r包装。使用原始计数信息，seurat对象或单旋转Perfermiment格式，用户可以在各个单元格之间执行和可视化GSEA。

作者：Nick Borcherding [AUT，CRE]，Jared Andrews [AUT]

维护者：nick borcherding

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ casseve”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“逃脱”）

html	R脚本	逃脱托托克
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	注解，，，，分类，，，，基因烯，，，，基因信号，，，，途径，，，，测序，，，，Singlecell，，，，软件
版本	1.7.0
在生物导体中	Bioc 3.12（R-4.0）（2年）
执照	GPL-2
要看	R（> = 4.1）
进口	grdevices，dplyr，，，，GGPLOT2，，，，gseabase，，，，GSVA，，，，Singlecellexperiment，，，，Ggridges，，，，msigdbr，统计生物比较，，，，矩阵，，，，Ucell，，，，扫帚，，，，RESHAPE2，，，，拼布，，，，矩阵，utils，rlang，，，，Stringr，，，，Data.Table，，，，总结性特征， 方法
链接
建议	Seurat，，，，seuratObject，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，降价，，，，生物使用，，，，测试，，，，Dittoseq（> = 1.1.2）
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我	CEPO
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	Escape_1.7.0.tar.gz
Windows二进制	Escape_1.7.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	Escape_1.7.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/escape
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/逃生
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/escape/
软件包下载报告	下载统计