Erccdashboard

doi:10.18129/b9.bioc.erccdashboard

这是发展Erccdashboard的版本;对于稳定版本,请参阅Erccdashboard

用ERCC对照评估差异基因表达实验

生物导体版本:开发(3.16)

使用外部RNA控件联盟(ERCC)尖峰比率混合物进行差异基因表达实验的技术性能指标。

作者:莎拉·蒙罗(Sarah Munro),史蒂夫·隆德(Steve Lund)

维护者:sarah munro

引用(从r内,输入引用(“ erccdashboard”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ erccdashboard”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ erccdashboard”)

PDF R脚本 Erccdashboard示例
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 替代方案,,,,批处理效应,,,,差异性,,,,差速器,,,,基因表达,,,,遗传学,,,,免疫学,,,,微阵列,,,,多重组合,,,,QualityControl,,,,rnaseq,,,,软件,,,,转录,,,,Mrnamicroarray
版本 1.31.0
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(7。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 3.2),GGPLOT2(> = 2.1.0),栅格(> = 2.0.0)
进口 EDGER,,,,GPLOTS, 网格,gtools,,,,林玛,,,,Locfit,,,,大量的,,,,plyr,,,,QVALUE,,,,RESHAPE2,,,,rocr,,,,,,,,Stringr
链接
建议
系统要求
增强
URL https://github.com/munrosa/erccdashboardhttp://tinyurl.com/erccsrm
BugReports https://github.com/munrosa/erccdashboard/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 erccdashboard_1.31.0.tar.gz
Windows二进制 erccdashboard_1.31.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) erccdashboard_1.31.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/erccdashboard
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/erccdashboard
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/erccdashboard/
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