这是发展Erccdashboard的版本;对于稳定版本,请参阅Erccdashboard。
生物导体版本:开发(3.16)
使用外部RNA控件联盟(ERCC)尖峰比率混合物进行差异基因表达实验的技术性能指标。
作者:莎拉·蒙罗(Sarah Munro),史蒂夫·隆德(Steve Lund)
维护者:sarah munro
引用(从r内,输入引用(“ erccdashboard”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ erccdashboard”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ erccdashboard”)
R脚本 | Erccdashboard示例 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 替代方案,,,,批处理效应,,,,差异性,,,,差速器,,,,基因表达,,,,遗传学,,,,免疫学,,,,微阵列,,,,多重组合,,,,QualityControl,,,,rnaseq,,,,软件,,,,转录,,,,Mrnamicroarray |
版本 | 1.31.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.0(R-3.1)(7。5年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | r(> = 3.2),GGPLOT2(> = 2.1.0),栅格(> = 2.0.0) |
进口 | EDGER,,,,GPLOTS, 网格,gtools,,,,林玛,,,,Locfit,,,,大量的,,,,plyr,,,,QVALUE,,,,RESHAPE2,,,,rocr,,,,秤,,,,Stringr |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/munrosa/erccdashboardhttp://tinyurl.com/erccsrm |
BugReports | https://github.com/munrosa/erccdashboard/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | erccdashboard_1.31.0.tar.gz |
Windows二进制 | erccdashboard_1.31.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | erccdashboard_1.31.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/erccdashboard |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/erccdashboard |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/erccdashboard/ |
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