epivizrData

DOI:10.18129 / B9.bioc.epivizrData

这是发展epivizrData版本;稳定的发布版本,请参阅epivizrData。

数据管理API epiviz交互式可视化应用

Bioconductor版本:发展(3.16)

从Bioconductor服务数据对象通过WebSocket连接。

作者:赫克托耳Corrada布拉沃(aut (cre)弗罗林Chelaru (aut)

维修工:赫克托耳Corrada布拉沃< hcorrada gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“epivizrData”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“epivizrData”)

HTML	R脚本	epivizrData用法
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	基础设施,软件,可视化
版本	1.25.0
Bioconductor自	BioC 3.3 (r - 3.3)(6.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R(> = 3.4),方法,epivizrServer(> = 1.1.1),Biobase
进口	S4Vectors,GenomicRanges,SummarizedExperiment(> = 0.2.0),OrganismDbi,GenomicFeatures,GenomeInfoDb,IRanges,ensembldb
链接
建议	testthat,roxygen2,bumphunter,hgu133plus2.db,Mus.musculus,TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.knownGene,rjson,knitr,rmarkdown,BiocStyle,EnsDb.Mmusculus.v79,AnnotationHub,rtracklayer跑龙套,RMySQL,DBI,matrixStats
SystemRequirements
增强了
URL	http://epiviz.github.io
BugReports	https://github.com/epiviz/epivizrData/issues
取决于我
进口我	epivizr,epivizrChart,metavizr,scTreeViz
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	epivizrData_1.25.0.tar.gz
Windows二进制	epivizrData_1.25.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	epivizrData_1.25.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epivizrData
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ epivizrData
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/epivizrData/
包下载报告	下载数据