epivizrChart

DOI:10.18129 / B9.bioc.epivizrChart

这是发展epivizrChart版本;稳定的发布版本,请参阅epivizrChart

R epiviz web组件的接口

Bioconductor版本:发展(3.17)

这个包提供了一个API使用epiviz基因组数据的交互式可视化的web组件。对象/ BioConductor可以用于生成交互式R减价R /笔记本文件或可以可视化工作室的默认浏览器。

作者:布莱恩·戈特弗里德(aut) Jayaram Kancherla (aut),赫克托耳Corrada布拉沃(aut (cre)

维修工:赫克托耳Corrada布拉沃< hcorrada gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“epivizrChart”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“epivizrChart”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“epivizrChart”)

HTML R脚本 介绍epivizrChart
HTML R脚本 使用epivizrChart可视化“RangeSummarizedExperiment”对象的应用程序
HTML R脚本 可视化文件epivizrChart
HTML R脚本 可视化在闪亮的应用程序使用epivizrChart基因组数据
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GUI,软件,可视化
版本 1.21.0
Bioconductor自 BioC 3.6 (r - 3.4)(5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 3.5.0)
进口 epivizrData(> = 1.5.1),epivizrServer,htmltools,rjson、方法、BiocGenerics
链接
建议 testthat,roxygen2,knitr,Biobase,GenomicRanges,S4Vectors,IRanges,SummarizedExperiment,antiProfilesData,hgu133plus2.db,Mus.musculus,BiocStyle,Homo.sapiens,闪亮的,minfi,Rsamtools,rtracklayer,RColorBrewer,magrittr,AnnotationHub
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 epivizrChart_1.21.0.tar.gz
Windows二进制 epivizrChart_1.21.0.zip
macOS二进制(x86_64) epivizrChart_1.21.0.tgz
macOS二进制(arm64) epivizrChart_1.21.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epivizrChart
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ epivizrChart
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/epivizrChart/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/epivizrChart/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网