epistack

DOI:10.18129 / B9.bioc.epistack

这是发展书信体版本;稳定版请参见epistack．

来自表观遗传信号的堆栈剖面热图

Bioconductor版本:开发(3.17)

书信体包的主要目标是基因组轨迹堆栈的可视化(如，但不限于，ChIP-seq, ATAC-seq, DNA甲基化或基因组守恒数据)集中在感兴趣的基因组区域。

作者:SACI Safia [aut]， DEVAILLY Guillaume [cre]

维护者:DEVAILLY Guillaume

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("epistack")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“epistack”)

超文本标记语言	R脚本	使用epistack
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	ChIPSeq，GeneExpression，预处理，RNASeq，软件
版本	1.5.0
在Bioconductor	bio3.14 (R-4.1)(1年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 4.1)
进口	GenomicRanges，SummarizedExperiment，BiocGenerics，S4Vectors，IRanges，viridisLite、图形、plotrix， grDevices，统计，方法
链接
建议	testthat(> = 3.0.0),BiocStyle，knitr，rmarkdown，EnrichedHeatmap，biomaRt，rtracklayer，covr，vdiffr，魔法
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	epistack_1.5.0.tar.gz
Windows二进制	epistack_1.5.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	epistack_1.5.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	epistack_1.5.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epistack
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/epistack
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/epistack/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/epistack/
软件包下载报告	下载数据