日期

doi：10.18129/b9.bioc.epimutacions

这是发展Epimutacions的版本；对于稳定版本，请参阅日期。

DNA甲基化数据的强大离群值鉴定

生物导体版本：开发（3.16）

该软件包包括一些在DNA甲基化数据中进行缩放检测的统计异常值检测方法。包装中包含的方法是MANOVA，多元线性模型，隔离森林，强大的Mahalanobis距离，分位数和β。该方法将病例样本与可疑疾病与参考面板（由健康个体组成）进行了比较，以鉴定给定病例样本中的缩影。它还包含注释和可视化已识别的弹药的功能。

作者：Leire Abarrategui [AUT，CRE]，Juan R. Gonzalez [aut]，Carlos Ruiz-Arenas [aut]，Carles Hernandez-Ferrer [aut]

维护者：leire abarrategui

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ epimutacions”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Epimutacions”）

html	R脚本	在甲基化数据中使用最先进的方法检测弹药
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	生物问题，，，，DNAMETHYLATY，，，，正常化，，，，预处理，，，，软件，，，，统计信息
版本	1.1.0
在生物导体中	Bioc 3.15（R-4.2）（<6个月）
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看	r（> = 4.2.0），Epimutacionsdata
进口	Minfi，，，，Bumphunter，，，，异托，，，，鲁棒，，，，GGPLOT2，，，，基因组机，，，，GenomicFeatures，，，，iranges，，，，总结性特征，统计矩阵，，，，生物基因，，，，S4VECTORS，utils，Biomart，，，，生物比较
链接
建议	AnnotationDbi，，，，AnnotationHub，，，，测试，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，生物使用，，，，A4base，，，，KableExtra，，，，Illuminahumanmethylation450Kanno.ILMN12.HG19，，，，Illuminahumanmethylation450Kmanifest，，，，光照明甲基甲基化epicmanifest，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg18.nown，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown，，，，rtracklayer， 方法，Ensembldb，，，，实验室，，，，Illuminahumanmethylationepicanno.ilm10b2.hg19， 网格，栅格，grdevices，蒂布尔，，，，GVIZ，，，，Ggrepel，，，，RESHAPE2，，，，purrr，，，，GenomeInfodB，，，，同性恋
系统要求
增强
URL	https://github.com/isglobal-brge/epimutacions
BugReports	https://github.com/isglobal-brge/epimutacions/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	epimutacions_1.1.0.tar.gz
Windows二进制	epimutacions_1.1.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	Epimutacions_1.1.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epimutacions
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/epimutacions
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/epimutacions/
软件包下载报告	下载统计