这是发展eiR版本;稳定版请参见eiR.
Bioconductor版本:开发(3.17)
eiR包提供了使用嵌入和索引方法加速非常大的小分子数据集的结构相似性搜索的实用程序。
作者:凯文·霍兰,曹益群,泰勒·贝克曼
维护者:Thomas Girke < Thomas。Girke在ucr.edu>
引文(从R内,输入引用(eiR)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.3”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("eiR")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes (eiR)
超文本标记语言 | R脚本 | eiR:小分子加速相似搜索 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 安装 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | BiomedicalInformatics,CellBasedAssays,Cheminformatics,聚类,DataImport,基础设施,代谢组学,MicrotitrePlateAssay,遗传药理学,药物基因组学,蛋白质组学,软件,可视化 |
版本 | 1.39.0 |
在Bioconductor | BioC 2.12 (R-3.0)(10年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 2.10.0),ChemmineR(>= 2.15.15),DBI |
进口 | 雪、工具、降雪,RUnit、方法、ChemmineR,RCurl,消化,BiocGenerics,RcppAnnoy(> = 0.0.9) |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitcitations,knitr,knitrBootstrap,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/girke-lab/eiR |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | eiR_1.39.0.tar.gz |
Windows二进制 | eiR_1.39.0.zip |
macOS二进制文件(x86_64) | eiR_1.39.0.tgz |
macOS二进制文件(arm64) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/eiR |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/eiR |
生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/eiR/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/eiR/ |
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