EDGER
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doi：10.18129/b9.bioc.edger
这是发展Edger的版本；对于稳定版本，请参阅EDGER。
R中数字基因表达数据的经验分析
生物导体版本：开发（3.13）
带有生物复制的RNA-SEQ表达谱的差异表达分析。基于负二项式分布，包括经验贝叶斯估计，精确测试，广义线性模型和准类似测试，实现了一系列统计方法。除RNA-Seq外，它还适用于其他类型的基因组数据的差异信号分析，这些数据产生了读数计数，包括chip-seq，atac-seq，bisulfite-seq，sage和cage。
作者：Yunshun Chen，Aaron TL Lun，Davis J McCarthy，Matthew E Ritchie，Belinda Phipson，Yifang Hu，Xiaobei Zhou，Mark D Robinson，Gordon K Smyth
维护者：yunshun chen
引用（从r内，输入引用（“ Edger”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：
if（！sireseNamespace（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: Install（decon ='devel'）Biocmanager :: Install（“ EDGER”）的用法
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Edger”）
| Edger Vignette | ||
| Edgerusersguide.pdf | ||
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | edger_3.33.7.tar.gz |
| Windows二进制 | edger_3.33.7.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | edger_3.33.7.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/edger |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/edger |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/edger/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
