边缘

doi：10.18129/b9.bioc.ded

这是发展Edge的版本；对于稳定版本，请参阅边缘。

提取差异基因表达

生物导体版本：开发（3.16）

Edge软件包实现了对全基因组基因表达研究进行差异表达分析的方法。使用最佳发现程序和普遍的似然比测试（相当于F检验和T检验）进行显着性测试，用于一般研究设计。可以使用特殊功能来促进分析常见研究设计，包括时间课程实验。SNM，SVA和QVALUE等其他软件包都集成在边缘，以提供广泛的基因表达分析工具。

作者：John D. Storey，Jeffrey T. Leek和Andrew J. Bass

维护者：John D. Storey ，Andrew J. Bass 的Ajbass>

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ edge”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“边缘”）

PDF	R脚本	边缘包
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	DataImport，，，，差异性，，，，基因表达，，，，多重组合，，，，回归，，，，软件，，，，时间科
版本	2.29.0
在生物导体中	Bioc 3.1（R-3.2）（7年）
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看	r（> = 3.1.0），生物酶
进口	方法，花键，SVA，，，，SNM，Jackstraw，QVALUE（> = 1.99.0），大量的
链接
建议	测试，，，，尼特，，，，GGPLOT2，，，，RESHAPE2
系统要求
增强
URL	https://github.com/jdstorey/Edge
BugReports	https://github.com/jdstorey/edge/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	edge_2.29.0.tar.gz
Windows二进制	edge_2.29.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	edge_2.29.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/edge
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/边缘
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/edge/
软件包下载报告	下载统计