- 家
- Bioconductor 3.17
- 软件包
- dupRadar(开发版)
dupRadar
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DOI:10.18129 / B9.bioc.dupRadar
这是发展dupRadar版本;稳定的发布版本,请参阅dupRadar。
对RNA-Seq重复率的评估数据集
Bioconductor版本:发展(3.17)
重复率RNA-Seq数据集的质量控制。
作者:塞尔吉Sayols < sergisayolspuig gmail.com >, Holger克莱因< Holger。克莱恩在gmail.com >
维护人员:塞尔吉Sayols < sergisayolspuig gmail.com >, Holger克莱因< Holger。克莱恩在gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“dupRadar”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“dupRadar”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“dupRadar”)
| HTML | R脚本 | 使用dupRadar |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | ImmunoOncology,质量控制,RNASeq,测序,软件,技术 |
| 版本 | 1.29.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.2 (r - 3.2)(7.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 3.2.0) |
| 进口 | Rsubread(> = 1.14.1),KernSmooth |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,AnnotationHub |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/dupRadarhttps://ssayols.github.io/dupRadar/index.html |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | dupRadar_1.29.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| macOS二进制(x86_64) | dupRadar_1.29.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | dupRadar_1.29.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dupRadar |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ dupRadar |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/dupRadar/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/dupRadar/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
