drugTargetInteractions

DOI:10.18129 / B9.bioc.drugTargetInteractions

这是发展drugTargetInteractions版本;稳定的发布版本,请参阅drugTargetInteractions。

药物相互作用

Bioconductor版本:发展(3.17)

提供实用工具以确定药物小分子或基因/蛋白质的交互集标识符。所需的药物相互作用信息试图从本地SQLite ChEMBL数据库的实例。ChEMBL已经选择了这个目的,因为它提供了最全面的和最佳annotatated知识资源药物信息在公共领域。

作者:托马斯Girke (cre, aut)

维护人员:托马斯Girke <托马斯。在ucr.edu girke >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“drugTargetInteractions”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“drugTargetInteractions”)

HTML	R脚本	药物相互作用
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BiomedicalInformatics,Cheminformatics,代谢组学,遗传药理学,药物基因组学,蛋白质组学,软件
版本	1.7.0
Bioconductor自	BioC 3.13 (r - 4.1)(1.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	方法,R (> = 4.1)
进口	跑龙套,RSQLite,UniProt.ws,biomaRt,ensembldb,BiocFileCache,dplyr,rappdirs,AnnotationFilter,S4Vectors
链接
建议	RUnit,BiocStyle,knitr,rmarkdown,ggplot2,reshape2,DT,EnsDb.Hsapiens.v86
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/girke-lab/drugTargetInteractions
BugReports	https://github.com/girke-lab/drugTargetInteractions
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	drugTargetInteractions_1.7.0.tar.gz
Windows二进制	drugTargetInteractions_1.7.0.zip
macOS二进制(x86_64)	drugTargetInteractions_1.7.0.tgz
macOS二进制(arm64)	drugTargetInteractions_1.7.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/drugTargetInteractions
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ drugTargetInteractions
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/drugTargetInteractions/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/drugTargetInteractions/
包下载报告	下载数据