dpeak
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doi：10.18129/b9.bioc.dpeak
这是发展DPEAK的版本；对于稳定版本，请参阅dpeak。
DPEAK（芯片序列分析中的峰值峰值）
生物导体版本：开发（3.16）
DPEAK是使用PET并设置ChIP-Seq和ChIP-EXO数据高分辨率识别蛋白DNA相互作用位点的统计框架。它提供了计算高效且用户友好的接口来处理芯片序列和芯片-EXO数据，实现探索性分析，拟合DPEAK模型以及预测绑定站点的导出列表，以进行下游分析。
作者：Dongjun Chung，Carter Allen
维护者：dongjun chung
引用（从r内，输入引用（“ dpeak”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ dpeak”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ dpeak”）
| R脚本 | dpeak | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | chipseq，，，，遗传学，，，，测序，，，，软件，，，，转录 |
| 版本 | 1.9.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.11（R-4.0）（2年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | R（> = 4.0.0），方法，统计，utils，Graphics，RCPP |
| 进口 | 大量的，，，，iranges，，，，BSGENOME，grdevices，平行 |
| 链接 | RCPP |
| 建议 | bsgenome.ecoli.ncbi.20080805 |
| 系统要求 | gnu make，meme，fimo |
| 增强 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/dongjunchung/dpeak/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | dpeak_1.9.0.tar.gz |
| Windows二进制 | dpeak_1.9.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | dpeak_1.9.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dpeak |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/dpeak |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/dpeak/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
