doppelgangr

doi:10.18129/b9.bioc.doppelgangr

这是发展Doppelgangr的版本;对于稳定版本,请参阅doppelgangr

确定可能从基因组或元数据中重复样品

生物导体版本:开发(3.16)

主要函数是Doppelgangr(),它作为最小输入列表的表达式对象列表,并搜索所有列表对重复样本。该搜索基于基因组数据(Exprs(ESET)),表型/临床数据(PDATA(ESET))和“吸烟枪” - 据称在PDATA(ESET)中发现的唯一标识符。

作者:Levi Waldron [AUT,CRE],Markus Reister [AUT,CTB],Marcel Ramos [CTB]

维护者:levi waldron

引用(从r内,输入引用(“ doppelgangr”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ doppelgangr”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ doppelgangr”)

html R脚本 Doppelgangr小插图
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 基因表达,,,,免疫学,,,,微阵列,,,,QualityControl,,,,rnaseq,,,,软件
版本 1.25.0
在生物导体中 Bioc 3.3(R-3.3)(6。5年)
执照 GPL(> = 2.0)
要看 r(> = 3.5.0),生物酶,,,,生物比较
进口 SVA,,,,,,,,消化,,,,mnormt,方法,grdevices,图形,统计信息,总结性特征,UTILS
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,策展人,,,,测试
系统要求
增强
URL https://github.com/lwaldron/doppelgangr
BugReports https://github.com/lwaldron/doppelgangr/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 doppelgangr_1.25.0.tar.gz
Windows二进制 doppelgangr_1.25.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) doppelgangr_1.25.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/doppelgangr
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/doppelgangr
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/doppelgangr/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网