这是发展Doppelgangr的版本;对于稳定版本,请参阅doppelgangr。
生物导体版本:开发(3.16)
主要函数是Doppelgangr(),它作为最小输入列表的表达式对象列表,并搜索所有列表对重复样本。该搜索基于基因组数据(Exprs(ESET)),表型/临床数据(PDATA(ESET))和“吸烟枪” - 据称在PDATA(ESET)中发现的唯一标识符。
作者:Levi Waldron [AUT,CRE],Markus Reister [AUT,CTB],Marcel Ramos [CTB]
维护者:levi waldron
引用(从r内,输入引用(“ doppelgangr”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ doppelgangr”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ doppelgangr”)
html | R脚本 | Doppelgangr小插图 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 基因表达,,,,免疫学,,,,微阵列,,,,QualityControl,,,,rnaseq,,,,软件 |
版本 | 1.25.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.3(R-3.3)(6。5年) |
执照 | GPL(> = 2.0) |
要看 | r(> = 3.5.0),生物酶,,,,生物比较 |
进口 | SVA,,,,算,,,,消化,,,,mnormt,方法,grdevices,图形,统计信息,总结性特征,UTILS |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,策展人,,,,测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/lwaldron/doppelgangr |
BugReports | https://github.com/lwaldron/doppelgangr/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | doppelgangr_1.25.0.tar.gz |
Windows二进制 | doppelgangr_1.25.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | doppelgangr_1.25.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/doppelgangr |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/doppelgangr |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/doppelgangr/ |
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