清楚的

DOI：10.18129 / b9.bioc.distint

这是发展明显的版本;对于稳定的版本版本，请参阅清楚的。

不同的：通过层级排列测试进行差分分析的方法

Bioconducts版本：开发（3.14）

截然不同的是在两种或更多种分布组之间执行差异测试的统计方法;通过每个样本的累积分布函数（CDF）上的分层非参数置换测试执行差分测试。While most methods for differential expression target differences in the mean abundance between conditions, distinct, by comparing full cdfs, identifies, both, differential patterns involving changes in the mean, as well as more subtle variations that do not involve the mean (e.g., unimodal vs. bi-modal distributions with the same mean). distinct is a general and flexible tool: due to its fully non-parametric nature, which makes no assumptions on how the data was generated, it can be applied to a variety of datasets. It is particularly suitable to perform differential state analyses on single cell data (i.e., differential analyses within sub-populations of cells), such as single cell RNA sequencing (scRNA-seq) and high-dimensional flow or mass cytometry (HDCyto) data. To use distinct one needs data from two or more groups of samples (i.e., experimental conditions), with at least 2 samples (i.e., biological replicates) per group.

作者：Simone Tiberi [Aut，CRE]，Mark D. Robinson [Aut]。

维护者：Simone Tiberi

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！qualocmanage（“biocmanager”，squally = true））install.packages（“biocmanager”）＃下面初始化buoc devel biocmanager ::安装（版本='devel'）biocmanager ::安装（“distinct”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“独特”）

HTML.	r script.	不同的：通过层级排列测试进行差分分析的方法
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	不同的亚兴那流动测定法那基因表达那geetarget.那遗传学那多匹匹莫森那rnaseq.那测序那SingleCell.那软件那统计方法那转录那可视化
版本	1.5.0.
在生物导体中以来	BIOC 3.11（R-4.0）（1年）
执照	GPL（> = 3）
依靠	r（> = 4.0）
进口	rcpp.，统计，概括分析那SinglecellexPeriment.， 方法，矩阵那Foreach.， 平行，多达齐全那dorng.那ggplot2.那林马那撒尿
链接到	rcpp.那rcpparmadillo.
建议	kn那testthat.那沮丧
系统要求	C ++ 11.
加强
URL.	https://github.com/simonetiberi/distint
Bugreports.	https://github.com/simonetiberi/distinted/issues.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包	distint_1.5.0.tar.gz.
Windows二进制文件
Macos 10.13（高塞拉）	distint_1.5.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/distinct
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包装/独特
包短网址	https://biocumon.org/packages/distint/
包裹下载报告	下载统计信息