不和谐的

DOI:10.18129 / B9.bioc.discordant

这是发展版本不一致的;稳定的发布版本,请参阅不和谐的。

不和谐的方法:微分相关的新方法

Bioconductor版本:发展(3.18)

不和谐的是R包标识对表型组之间关联不同的特性,应用组学数据集。不和谐的使用一个混合模型,“垃圾箱”分子特性对基于类型的coexpression或coabbundance。算法进一步解释“微分测序数据的相关性”“(Siska et al . 2016年)。

作者:夏洛特Siska (aut),麦格拉思马克斯(aut (cre) (Katerina Kechris (aut cph,年代)

维修工:麦格拉思马克斯<马克斯。麦格拉思ucdenver.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“不和谐”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“不和谐”)

HTML	R脚本	不和谐的R包:一个微分相关的新方法
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BiologicalQuestion,遗传学,ImmunoOncology,微阵列,RNASeq,软件,StatisticalMethod,mRNAMicroarray
版本	1.23.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(6年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.1.0)
进口	Rcpp,Biobase、统计、biwt gtools、质量、工具、dplyr,方法,跑龙套
链接	Rcpp
建议	BiocStyle、knitr testthat (> = 3.0.0)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/siskac/discordant
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	discordant_1.23.0.tar.gz
Windows二进制	discordant_1.23.0.zip
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/discordant
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/不和谐
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/discordant/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/discordant/
包下载报告	下载数据