- 家
- Bioconductor 3.17
- 软件包
- diffcoexp(开发版)
diffcoexp
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DOI:10.18129 / B9.bioc.diffcoexp
这是发展diffcoexp版本;稳定的发布版本,请参阅diffcoexp。
微分Co-expression分析
Bioconductor版本:发展(3.17)
识别不同的工具coexpressed链接(dcl)和不同coexpressed基因(DCGs系统)。dcl基因对有明显不同的两种条件下的相关系数。DCGs系统与偶然dcl明显多于基因。
作者:Wenbin魏,Sandeep Amberkar,温斯顿躲起来
维护人员:Wenbin魏< Wenbin。微微在durham.ac.uk >
从内部引用(R,回车引用(“diffcoexp”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“diffcoexp”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“diffcoexp”)
| R脚本 | 关于diffcoexp | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 报道,DifferentialExpression,GeneExpression,ImmunoOncology,微阵列,OneChannel,RNASeq,测序,软件,转录,TwoChannel |
| 版本 | 1.19.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.7 (r - 3.5)(4.5年) |
| 许可证 | GPL (> 2) |
| 取决于 | R (> = 3.5),WGCNA,SummarizedExperiment |
| 进口 | 统计数据,DiffCorr,心理,igraph,BiocGenerics |
| 链接 | |
| 建议 | GEOquery |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/hidelab/diffcoexp |
| 取决于我 | |
| 进口我 | ExpHunterSuite |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | diffcoexp_1.19.0.tar.gz |
| Windows二进制 | diffcoexp_1.19.0.zip(64位) |
| macOS二进制(x86_64) | diffcoexp_1.19.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | diffcoexp_1.19.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/diffcoexp |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ diffcoexp |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/diffcoexp/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/diffcoexp/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
