命运

DOI:10.18129 / B9.bioc.destiny

这是发展版本的命运;稳定的发布版本,请参阅命运。

创建扩散地图

Bioconductor版本:发展(3.14)

创建和情节扩散地图。

作者:菲利普•安格勒<菲利普。安格勒在helmholtz-muenchen.de >,Laleh Haghverdi , Maren Büttner , Fabian Theis , Carsten Marr , Florian Büttner

维护人员:菲利普•安格勒<菲利普。安格勒在helmholtz-muenchen.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“命运”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	CellBasedAssays,CellBiology,聚类,软件,可视化
版本	3.7.0
Bioconductor自	BioC 3.2 (r - 3.2)(5.5年)
许可证	GPL
取决于	R (> = 3.4.0)
进口	方法、图形、grDevices跑龙套,统计数据,矩阵,Rcpp(> = 0.10.3),RcppEigen,RSpectra(0.14 > = 0),irlba,pcaMethods,Biobase,BiocGenerics,SummarizedExperiment,SingleCellExperiment,ggplot2,ggplot.multistats,tidyr,tidyselect,ggthemes,VIM,knn.covertree,代理,RcppHNSW,平滑,尺度,scatterplot3d
链接	Rcpp,RcppEigen,grDevices
建议	nbconvertR(> = 1.3.2),igraph,testthat,模糊神经网络,tidyr
SystemRequirements	c++ 11日jupyter nbconvert(见nbconvertR的安装文件)
增强了	rgl,SingleCellExperiment
URL	https://theislab.github.io/destiny/https://github.com/theislab/destiny/https://www.helmholtz-muenchen.de/icb/destiny//www.anjoumacpherson.com/packages/destinyhttps://doi.org/10.1093/bioinformatics/btv715
BugReports	https://github.com/theislab/destiny/issues
取决于我
进口我	ctgGEM,CytoTree,phemd
建议我	CelliD,CellTrails,单片眼镜,嘘
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/destiny
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/命运
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/destiny/
包下载报告	下载数据