这是发展derfinderHelper版本;稳定的发布版本,请参阅derfinderHelper。
Bioconductor版本:发展(3.17)
辅助计划加快derfinder包当使用多核。这个包是使用BiocParallel时特别有用,它有助于减少加载时间满derfinder包并行运行时统计量的计算。
作者:达芬奇Collado-Torres (aut (cre)安德鲁·e·贾菲(aut)黑色,杰弗里·t .韭菜(aut)
维护人员:达芬奇Collado-Torres < lcolladotor gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“derfinderHelper”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“derfinderHelper”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“derfinderHelper”)
HTML | R脚本 | 介绍derfinderHelper |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DifferentialExpression,ImmunoOncology,RNASeq,测序,软件 |
版本 | 1.33.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.0 (r - 3.1)(8.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 3.2.2) |
进口 | IRanges(> = 1.99.27),矩阵、方法、S4Vectors(> = 0.2.2) |
链接 | |
建议 | sessioninfo,knitr(> = 1.6),BiocStyle(> = 2.5.19),RefManageR,rmarkdown(> = 0.3.3),testthat,covr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/leekgroup/derfinderHelper |
BugReports | https://support.bioconductor.org/t/derfinderHelper |
取决于我 | |
进口我 | derfinder |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | derfinderHelper_1.33.0.tar.gz |
Windows二进制 | derfinderHelper_1.33.0.zip |
macOS二进制(x86_64) | derfinderHelper_1.33.0.tgz |
macOS二进制(arm64) | derfinderHelper_1.33.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/derfinderHelper |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ derfinderHelper |
Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/derfinderHelper/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/derfinderHelper/ |
包下载报告 | 下载数据 |