司布

DOI：10.18129 / b9.bioc.dasper.

这是发展司布的版本;对于稳定的版本版本，请参阅司布。

检测来自RNA测序数据的紫黑拼接事件

Bioconducts版本：开发（3.14）

司布的目的是从RNA-SEQ数据检测异常剪接事件。搅拌将使用来自RNA-SEQ的输入和覆盖数据，以计算来自一组用户定义控件的患者中的每个拼接事件的偏差。司布使用无监督的异常值检测算法在患者中得分，以表示拼接事件看起来异常的程度的异常值。

作者：大卫张[AUT，CRE]，Leonardo Collado-Torres [CTB]

维护者：David Zhang

安装

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if（！qualocmamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）＃以下初始化buoc devel biocmanager :: install的使用（版本='devel'）biocmanager ::安装（“dasper”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

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HTML.	r script.	司布介绍
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	替代品那覆盖范围那rnaseq.那测序那软件那转录组学
版本	1.3.0
在生物导体中以来	BIOC 3.12（R-4.0）（0.5岁）
执照	艺术-2.0
依靠	r（> = 4.0）
进口	斯巴里斯克那biocfilecache.那生物相投那data.table.那dplyr.那Genomeinfodb.那基因组法那Genomicranges.那绞喉那Magrittr.那Megadepth.， 方法，普利兰语那读书那ret那S4Vectors.那stringr.那概括分析那Tidyr.
链接到
建议	生物焦那Covr.那testthat.，基因组，ggplot2.那ggpubr.那GGRepel.， 网格，kniTcitations.那kn那叙事那RAMAMAMDOW.那sessioninfo.那rtracklayer.那娇媚
系统要求
加强
URL.	https://github.com/dzhang32/dasper.
Bugreports.	https://support.biocumon.org/t/dasper.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
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包档案包

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源包	dasper_1.3.0.tar.gz.
Windows二进制文件
Macos 10.13（高塞拉）	dasper_1.3.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/dasper.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包装/搅拌器
包短网址	https://biocumon.org/packages/dasper/
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