dStruct

DOI:10.18129 / B9.bioc.dStruct

这是发展dStruct的版本;稳定版请参见dStruct．

从RNA结构分析数据中识别差异反应区

Bioconductor版本:开发(3.17)

dStruct从RNA结构分析数据中识别差异反应区。dStruct与广泛的结构分析技术兼容，例如，SHAPE-MaP, DMS-MaPseq, Structure-Seq, SHAPE-Seq等。参见Choudhary等人，《基因组生物学》，2019年，了解基本方法。

作者:Krishna Choudhary [aut, cre]，莎朗·阿维兰[au]

维护者:Krishna Choudhary

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("dStruct")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“dStruct”)

超文本标记语言	R脚本	使用“dStruct”进行差异RNA结构分析
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	测序，软件，StatisticalMethod，StructuralPrediction
版本	1.5.0
在Bioconductor	BioC 3.14 (R-4.1)(1.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 4.1)
进口	动物园，ggplot2，purrr，reshape2平行,IRanges，S4Vectors，rlang， grDevices, stats, utils
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat(> = 3.0.0)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/dataMaster-Kris/dStruct
BugReports	https://github.com/dataMaster-Kris/dStruct/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	dStruct_1.5.0.tar.gz
Windows二进制	dStruct_1.5.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	dStruct_1.5.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	dStruct_1.5.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dStruct
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/dStruct
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/dStruct/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/dStruct/
软件包下载报告	下载数据