cydar

DOI:10.18129 / B9.bioc.cydar

这是发展cydar版本;稳定版请参见cydar．

用质量细胞仪进行差异丰度分析

Bioconductor版本:开发(3.16)

在大规模细胞术数据中识别样本和组之间差异丰富的群体。提供用于将细胞计数为超球、控制空间错误发现率以及在高维标记空间中可视化丰度变化的方法。

作者:Aaron Lun [aut, cre]

维护者:Aaron Lun 的键盘

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("cydar")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“cydar”)

超文本标记语言	R脚本	差异丰度检测
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	FlowCytometry，ImmunoOncology，MultipleComparison，蛋白质组学，SingleCell，软件
版本	1.21.0
在Bioconductor	BioC 3.5 (R-3.4)(5年)
许可证	GPL-3
取决于	SingleCellExperiment
进口	冬青、方法、闪亮的，图形，统计，grDevices, utils，BiocGenerics，S4Vectors，BiocParallel，SummarizedExperiment，flowCore，Biobase，Rcpp，BiocNeighbors
链接	Rcpp
建议	ncdfFlow，testthat，rmarkdown，knitr，刨边机，limma，glmnet，BiocStyle，flowStats
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	cydar_1.21.0.tar.gz
Windows二进制	cydar_1.21.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	cydar_1.21.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cydar
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/cydar
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cydar/
软件包下载报告	下载数据