腰带

DOI:10.18129 / B9.bioc.cummeRbund

这是发展版本的腰带;稳定的发布版本,请参阅腰带。

分析、勘探、操纵和袖扣高通量测序数据的可视化。

Bioconductor版本:发展(3.17)

允许持久存储、访问、勘探和袖扣高通量测序数据的操作。此外,提供了大量的绘图函数常用的可视化。

作者:l·高夫,c·杰尔·d·凯利

维护人员:忠诚的a·高夫< lgoff csail.mit.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“腰带”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes(腰带)

PDF	R脚本	腰带用户指南
PDF	R脚本	样本腰带工作流
PDF		参考手册
文本		自述
文本		新闻

细节

biocViews	生物信息学,聚类,DataImport,DataRepresentation,DifferentialExpression,GeneExpression,HighThroughputSequencing,HighThroughputSequencingData,基础设施,MultipleComparisons,质量控制,RNAseq,RNAseqData,软件,可视化
版本	2.41.0
Bioconductor自	BioC 2.9 (r - 2.14)(11年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 2.7.0),BiocGenerics(> = 0.3.2),RSQLite,ggplot2,reshape2,fastcluster,rtracklayer,Gviz
进口	方法,plyr,BiocGenerics,S4Vectors(> = 0.9.25),Biobase
链接
建议	集群,plyr,NMFN,stringr,GenomicFeatures,GenomicRanges,rjson
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	cummeRbund_2.41.0.tar.gz
Windows二进制	cummeRbund_2.41.0.zip
macOS二进制(x86_64)	cummeRbund_2.41.0.tgz
macOS二进制(arm64)	cummeRbund_2.41.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cummeRbund
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/腰带
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/cummeRbund/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cummeRbund/
包下载报告	下载数据