ctsGE

DOI:10.18129 / B9.bioc.ctsGE

这是发展ctsGE版本;稳定版请参见ctsGE．

时间序列基因表达数据的聚类

Bioconductor版本:开发(3.17)

时间序列数据集中潜在的许多预测变量(如基因等)的监督聚类方法提供了帮助用户将基因分配到预定义的模型配置文件集的功能。

作者:Michal Sharabi-Schwager [aut, cre]， Ron Ophir [aut]

维护者:Michal Sharabi-Schwager

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("ctsGE")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ctsGE”)

超文本标记语言	R脚本	ctsGE包
PDF		参考手册

细节

biocViews	贝叶斯，聚类，DifferentialExpression，GeneExpression，GeneSetEnrichment，遗传学，ImmunoOncology，RNASeq，测序，软件，TimeCourse，转录
版本	1.25.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(6.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.2)
进口	ccaPP，ggplot2，limma，reshape2，闪亮的统计数据,stringr,跑龙套
链接
建议	BiocStyle，dplyr，DT，GEOquery，knitr，老鸨，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/michalsharabi/ctsGE
BugReports	https://github.com/michalsharabi/ctsGE/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	ctsGE_1.25.0.tar.gz
Windows二进制	ctsGE_1.25.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	ctsGE_1.25.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	ctsGE_1.25.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ctsGE
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ctsGE
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/ctsGE/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ctsGE/
软件包下载报告	下载数据