conumee

DOI:10.18129 / B9.bioc.conumee

这是发展conumee版本;稳定的发布版本,请参阅conumee。

增强人类基因组变异分析使用Illumina公司DNA甲基化数组

Bioconductor版本:发展(3.17)

这个包包含一组处理和绘制方法进行人类基因组变异(CNV)的分析使用Illumina公司450 k或史诗甲基化数组。

作者:Volker Hovestadt, Marc Zapatka

维护人员:Volker Hovestadt < conumee在hovestadt.bio >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“conumee”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“conumee”)

HTML	R脚本	conumee
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CopyNumberVariation,DNAMethylation,MethylationArray,微阵列,归一化,预处理,质量控制,软件
版本	1.33.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(8年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.5.0),minfi,IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19,IlluminaHumanMethylation450kmanifest,IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b2.hg19,IlluminaHumanMethylationEPICmanifest
进口	方法、统计数据DNAcopy,rtracklayer,GenomicRanges,IRanges,GenomeInfoDb
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,minfiData,RCurl
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	CopyNeutralIMA
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	conumee_1.33.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)	conumee_1.33.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/conumee
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ conumee
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/conumee/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/conumee/
包下载报告	下载数据