contibait
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doi：10.18129/b9.bioc.contibait
这是发展Contibait的版本；对于稳定版本，请参阅contibait。
使用Strand-Seq数据改善早期构建基因组组件
生物导体版本：开发（3.16）
使用来自将要组装的生物体的多个单个单元的链遗传数据，Contibait可以将未纹理的重叠合聚集到假定的染色体中，并在这些染色体中订购重叠群。
作者：Kieran O'Neill，Mark Hills，Mike Gottlieb
维护者：Kieran O'Neill
引用（从r内，输入引用（“ contibait”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ contibait”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ contibait”）
| R脚本 | Flowbi | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 蜂窝基，，，，遗传学，，，，基因组组件，，，，免疫学，，，，QualityControl，，，，软件，，，，全媒体 |
| 版本 | 1.25.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.3（R-3.3）（6年） |
| 执照 | bsd_2_clause +文件执照 |
| 要看 | r（> = 3.5.0），BH（> = 1.51.0.3），rsamtools（> = 1.21） |
| 进口 | Data.Table，grdevices，线索，，，，簇，，，，GPLOTS，，，，生物基因（> = 0.31.6），S4VECTORS，，，，iranges，，，，基因组机，，，，RCPP，，，，TSP，，，，Genomicfiles，，，，gtools，，，，rtracklayer，，，，生物比较，，，，DNACOPIGY，，，，色彩空间，，，，RESHAPE2，，，，GGPLOT2， 方法，外观复制，，，，基因组签名，，，，图表 |
| 链接 | RCPP，，，，BH |
| 建议 | 生物使用 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | contibait_1.25.0.tar.gz |
| Windows二进制 | contibait_1.25.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | contibait_1.25.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/contibait |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/contibait |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/contibait/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
