调味品

DOI:10.18129 / B9.bioc.condiments

这是发展版本的调味品;稳定的发布版本,请参阅调味品。

微分拓扑,进展和分化

Bioconductor版本:发展(3.17)

这个包封装许多函数进行微分拓扑分析。它着重于分析一个“使数据集与多个条件。虽然包主要是面向scRNASeq,但没有地方限制实际的输入格式。

作者:赫克托耳Roux de Bezieux (aut (cre),柯恩Van den Berge aut,施莱,凯利街(aut,施莱)

维修工:赫克托耳Roux de Bezieux <赫克托耳。在berkeley.edu rouxdebezieux >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“调味品”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“调味品”)

HTML	R脚本	生成更多的例子
HTML	R脚本	调味品的工作流
HTML	R脚本	使用的调味品
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文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	MultipleComparison,RNASeq,测序,SingleCell,软件,转录组,可视化
版本	1.7.0
Bioconductor自	BioC 3.13 (r - 4.1)(1.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 4.0)
进口	弹弓(> = 1.9),mgcv,RANN统计数据,SingleCellExperiment,SummarizedExperiment跑龙套,magrittr,dplyr(> = 1.0),Ecume(> = 0.9.1)、方法pbapply,matrixStats,BiocParallel,TrajectoryUtils,igraph,截然不同的
链接
建议	knitr,testthat,rmarkdown,covr,冬青,ggplot2,RColorBrewer,randomForest,tidyr,TSCAN
SystemRequirements
增强了
URL	https://hectorrdb.github.io/condiments/index.html
BugReports	https://github.com/HectorRDB/condiments/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	condiments_1.7.0.tar.gz
Windows二进制	condiments_1.7.0.zip
macOS二进制(x86_64)	condiments_1.7.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/condiments
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/调味品
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/condiments/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/condiments/
包下载报告	下载数据