结合

DOI:10.18129 / B9.bioc.combi

这是发展版本的结合;稳定的发布版本,请参阅结合。

组成的组学基于模型的可视化集成

Bioconductor版本:发展(3.17)

这种探究的祝圣礼方法结合quasi-likelihood估计,成分回归模型和潜变量模型综合几个组学数据集的可视化。无约束和约束集成是可用的。结果显示为可判断的,成分的多图。

作者:Stijn Hawinkel (cre, aut)

维护人员:Stijn Hawinkel < Stijn。在psb.ugent.be hawinkel >

安装

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“联合”)

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HTML	R脚本	手册结合pacakage
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文本		新闻

细节

biocViews	DimensionReduction,代谢组学,宏基因组,微生物组,软件,可视化
版本	1.11.0
Bioconductor自	BioC 3.11 (r - 4.0)(2.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 4.0),DBI
进口	ggplot2,nleqslv,phyloseq,张量统计数据,limma,矩阵,BB,reshape2,阿拉巴马州,玉米穗轴,Biobase,素食主义者、grDevices、图形、方法SummarizedExperiment
链接
建议	knitr,rmarkdown,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/CenterForStatistics-UGent/combi/issues
取决于我
进口我
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	combi_1.11.0.tar.gz
Windows二进制	combi_1.11.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	combi_1.11.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/combi
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/联合
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/combi/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/combi/
包下载报告	下载数据