clusterSeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.clusterSeq

这是发展clusterSeq版本;稳定的发布版本请参见clusterSeq。

通过识别共表达模式来聚类高通量测序数据

生物导体版本:开发(3.14)

基于在多个(复制)生物样本中表达的共表达基因簇的鉴定。

作者:Thomas J. Hardcastle & Irene Papatheodorou

维护者:Thomas J. Hardcastle

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("clusterSeq")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“clusterSeq”)

PDF	R脚本	先进baySeq分析
PDF		参考手册

细节

biocViews	聚类,DifferentialExpression,GeneExpression,MultipleComparison,测序,软件
版本	1.17.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (R-3.4)(4年)
许可证	GPL-3
取决于	R(>= 3.0.0)，方法，BiocParallel,baySeq，图像，统计，效用
进口	BiocGenerics
链接
建议	BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	clusterSeq_1.17.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)	clusterSeq_1.17.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/clusterSeq
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ clusterSeq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/clusterSeq/
包下载报告	下载数据