- 家
- Bioconductor 3.17
- 软件包
- chromPlot(开发版)
chromPlot
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DOI:10.18129 / B9.bioc.chromPlot
这是发展chromPlot版本;稳定的发布版本,请参阅chromPlot。
全球基因组数据的可视化工具
Bioconductor版本:发展(3.17)
包装设计可视化沿着染色体基因组数据,纵向染色体按数量排序,最后与性染色体。
作者:里卡多·a . Verdugo和卡伦y Orostica
维护人员:凯伦y Orostica < korostica09 gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“chromPlot”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“chromPlot”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“chromPlot”)
| R脚本 | 一般的手动 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 注释,DataRepresentation,FunctionalGenomics,遗传学,测序,软件,可视化 |
| 版本 | 1.27.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.3 (r - 3.3)(6.5年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | 统计数据、跑龙套、图形、grDevices数据集,基地,biomaRt,GenomicRangesR (> = 3.1.0) |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | qtl,GenomicFeatures,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | chromPlot_1.27.0.tar.gz |
| Windows二进制 | chromPlot_1.27.0.zip(64位) |
| macOS二进制(x86_64) | chromPlot_1.27.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | chromPlot_1.27.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chromPlot |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ chromPlot |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/chromPlot/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/chromPlot/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
