chimeraviz

DOI:10.18129 / B9.bioc.chimeraviz

这是发展嵌合体的版本;稳定版请参见chimeraviz．

基因融合的可视化工具

Bioconductor版本:开发(3.16)

Chimeraviz管理来自融合基因发现者的数据，并提供有用的可视化工具。

作者:Stian Lågstad [aut, cre]， Sen Zhao [ctb]， Andreas M. Hoff [ctb]， Bjarne Johannessen [ctb]， Ole Christian Lingjærde [ctb]， Rolf Skotheim [ctb]

维护者:Stian Lågstad

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("chimeraviz")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“chimeraviz”)

超文本标记语言	R脚本	chimeraviz
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	对齐，基础设施，软件
版本	1.23.0
在Bioconductor	BioC 3.5 (R-3.4)(5.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	Biostrings，GenomicRanges，IRanges，Gviz，S4Vectors，ensembldb，AnnotationFilter，data.table
进口	方法、网格Rsamtools，GenomeInfoDb，GenomicAlignments，RColorBrewer、图形、AnnotationDbi，RCircos，org.Hs.eg.db，org.Mm.eg.db，rmarkdown，图，Rgraphviz，DT，plyr，dplyr，BiocStyle，使彻底失败，gtools，魔法
链接
建议	testthat，roxygen2，devtools，knitr，lintr
SystemRequirements	有些功能需要Bowtie、samtools和egrep
增强了
URL	https://github.com/stianlagstad/chimeraviz
BugReports	https://github.com/stianlagstad/chimeraviz/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	chimeraviz_1.23.0.tar.gz
Windows二进制	chimeraviz_1.23.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	chimeraviz_1.23.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chimeraviz
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/chimeraviz
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/chimeraviz/
软件包下载报告	下载数据