cellxgenedp

DOI:10.18129 / B9.bioc.cellxgenedp

这是发展cellxgenedp版本;稳定的发布版本,请参阅cellxgenedp。

发现和访问单个细胞数据集cellxgene数据门户

Bioconductor版本:发展(3.17)

cellxgene数据门户网站(https://cellxgene.cziscience.com/)提供了一个图形用户接口的集合单细胞序列数据处理标准方法计算矩阵的摘要。cellxgenedp包提供了一种替代方法,R-based inteface, allowind数据发现,观看和下载。

作者:马丁·摩根(aut (cre),凯拉Interdonato (aut)

维修工:马丁·摩根< mtmorgan。在gmail.com bioc >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“cellxgenedp”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“cellxgenedp”)

HTML	R脚本	发现并从cellxgene下载数据集和文件数据门户
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,SingleCell,软件,ThirdPartyClient
版本	1.3.1
Bioconductor自	BioC 3.15 (r - 4.2)(0.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	dplyr
进口	httr,旋度,jsonlite,跑龙套,工具,闪亮的,DT,rjsoncons
链接
建议	zellkonverter,SingleCellExperiment,HDF5Array,BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat(> = 3.0.0),嘲笑
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	cellxgenedp_1.3.1.tar.gz
Windows二进制	cellxgenedp_1.3.1.zip
macOS二进制(x86_64)	cellxgenedp_1.3.1.tgz
macOS二进制(arm64)	cellxgenedp_1.3.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cellxgenedp
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ cellxgenedp
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/cellxgenedp/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cellxgenedp/
包下载报告	下载数据